城市看到了原来的高中，迎来了平静祥和的一天。二年级的女孩鹿目圆(由悠木碧配音)和她的朋友米舒·沙耶加(由喜多村英梨配音)和支竹·仁美(由新谷亮子配音)讨论了爱情的话题，并欣赏了《女孩 快乐和青春。这时，一个名叫晓美焰(由斋藤千和配音)的新同学来到了班上。这个带着一点神秘气质的女孩迷惑了小源。在和沙耶加放学回家的路上，小源听到了呼救声。这个声音来自一个浑身伤痕的未知生物，正是晓美焰在追踪它。在，他们得到了巴麻美(由水桥香织配音)的帮助，这是一个魔法女孩，也是Kanehara中学的学生，然后得知这个名叫丘比特的生物有能力帮助人们成为魔法女孩。女孩无意中打开了另一个世界的大门...

本片是魔幻少女的剧场版，分三部上映，由12字的电视版重新剪辑而成。